Analyse du 20 Mai 2020

Bonjour,

Quelques éléments d’analyse sur les graphs:

  • France: nous sommes passés sous la barre de 2000 personnes en réanimation. Les chiffres continuent à être encourageants. Pour plus de détails sur la France, que ce soit à l’échelle nationale ou régionale, vous pouvez consulter cette page qui a été mise à jour.
  • US: les graphs mondiaux qui présentent des données lissées sur 7 jours présentent bien cette réelle décroissance que les US vivent, même si dans certains états le virus circule toujours activement.
  • Italie: chez notre voisin transalpin, le nombre de morts journaliers continue à être très en dessous de ce qui était observé début mars.
  • Allemagne: les allemands comptabilisent moins de 50 morts/jour depuis 4 jours: la situation semble réellement sous contrôle.

Bonne journée,

Clément


Ces briefs sont publiés 3 fois par semaine, les lundis, mercredis et vendredis.

La liste complète des outils développés pour l’analyse, disponible sur ce site:

  • Les graphs: publiés tri-hebdomadairement
  • Les cartes: 3 cartes du monde (nombres de cas, nombres de décès et bilan de la progression du nombre du cas) et 1 carte de la France. Elles sont mises à jour quotidiennement.
  • Les prédictions: en bas de l’article, les prédictions du nombre de cas final. Elles sont mises à jour quotidiennement. Je rappelle que ces prédictions (i.e. les modèles mathématiques) se basent sur les conditions des dernières semaines (e.g. nombre de contacts moyens par personne et par jour). Ainsi, quand les règles de circulation seront assouplies, rien n’empêchera une seconde vague d’arriver, même si les prédictions ne le montrent pas.
  • L’analyse du cas français: les données spécifiques à la France sur le nombre de personnes en réanimation, nombre de personnes hospitalisés et le nombre de décès à l’échelle nationale et régionale.
  • L’ensemble des graphs mondiaux: même graphs que ceux publiés tri-hebdomadairement mais pour tous les pays du monde ayant plus de 1% des cas mondiaux

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Analyse du 18 Mai 2020

Bonjour à tous,

Comme tous les WE, j’essaie d’améliorer les représentations ou d’en ajouter de nouvelles. Cette semaine, vous trouverez donc en supplément :

  • Des graphs à l’échelle régionale en France avec la situation dans les hôpitaux (réa et nombre d’hospitalisés) et nombre de décès totaux/journaliers.
  • Les graphs pour l’ensemble des pays ayant plus de 3% des cas mondiaux. Sur ces derniers, les pays sont affichés par ordre décroissant du nombre de cas.

Graphs journaliers

  • France: on le voit en ce moment, les chiffres sont analysés au jour le jour dans les médias afin de guetter l’arrivée d’une nouvelle vague. Comme je l’avais mentionné la semaine dernière, depuis le début de l’épidémie, le nombre journalier de cas/décès est très variable en fonction des jours, il faudrait les moyenner sur environ une semaine pour voir la réelle tendance lissée. Globalement, il n’y a pas de signes de 2nde vague même si le virus circule activement, des clusters existent mais ils sont identifiés et les cas contacts sont tracés.
  • US: le nombre de cas et de décès baisse lentement mais de manière assez continue (pour une tendance globale, je vous recommande les graphs plus bas lissés sur 7j). Espérons que cela continue.
  • Italie: la situation italienne est très encourageante : cela fait 2 semaines qu’ils sont déconfinés et il n’y a pas eu de 2nde vague, pour le moment.
  • Allemagne: pour les allemands aussi le déconfinement semble fonctionner. Les clusters dans les abattoirs ne semblent pas s’être propagé. La filière est d’ailleurs à observer, des cas ayant été révélés en France aussi.

Graphs globaux

Régions françaises

Les données sont lissées sur [-2j, +2j]

On remarquera que seule Mayotte ne montre pas de signes d’améliorations.

Cliquez dessus pour faire apparaître toutes les pages

Graphs mondiaux

Sont donc représentés ci-dessous seulement les pays ayant plus de 3% des cas mondiaux (plus de 40 000).

Les pays dans le PDF apparaissent dans l’ordre décroissant du nombre de cas.

Il est intéressant de voir que seuls 17 pays (sur les 189 sur lesquels nous avons des données) ont plus de 3% des données. Il faut cependant réaliser que les pays ayant le plus de cas sont aussi ceux qui développent un maximum de moyens pour la détection.

La Russie a le 2e plus grand nombre de cas avec 282 000 contaminations. Même si elle comptabilise assez peu de décès (1631), ce chiffre est remis en doute.

Les données sont lissées sur [-3j,+3j] i.e. sur une semaine

Cliquez dessus pour faire apparaitre toutes les pages

Bonne journée,

Clément

Analyse du 15 Mai 2020

Bonjour à tous,

Voici quelques éléments d’analyse pour les graphs du jour:

  • France: le nombre de nouveaux cas journaliers est constant depuis quelques jours. Cependant cela n’indique pas nécessairement une reprise des cas, il est encore un peu tôt pour observer les effets du déconfinement. De plus, on a déjà observé une baisse par palier. Les indicateurs côtés hôpitaux continuent de baisser. Je vous inviter à venir ici pour les observer. Pour mettre les prédictions en perspective, une croissance « normale » dans les prochains jours serait de +400 cas/j (±200, les chiffres restent assez variables d’un jour à l’autre)
  • US: la baisse semble réellement engagée. Leurs chiffres auraient plus de sens s’ils étaient lissés avec une moyenne mobile sur 7j. Il semble y avoir -5000 nouveaux cas/j tous les 8/10j (pour les pays européens, la baisse était autour de -1000 nouveaux cas/j tous les 8/10j). Les prédictions commencent d’ailleurs à se stabiliser.
  • Italie: l’Italie semble avoir 1000 cas/j depuis 4/5j. Comme pour la France, cela n’indique pas forcément une recirculation active du virus, il faudra observer la situation lundi.
  • Allemagne: les nouveaux clusters allemands dont nous avons parlé la semaine dernière semblent bien être locaux, il n’y pas de nouveaux cas en masse.

Bonne journée,

Clément

Analyse du 13 Mai 2020

Bonjour à tous

Globalement, dans le monde:

  • France: alors que nous nous habituons à une vie qui sera marquée par des cercles de 4m2, la situation française reste plutôt bonne, nous avons désormais autant de décès journaliers qu’en Allemagne.
  • US: il existe encore des clusters actifs à l’échelle des comtés, en particulier dans le Minnesota, l’État de Washington et en Caroline du Nord.
  • Italie: rien de nouveau par rapport à hier.
  • Allemagne: idem.

Pour la France spécifiquement:

Bonne journée à tous,

Clément


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  • Les cartes: 3 cartes du monde (nombres de cas, nombres de décès et bilan de la progression du nombre du cas) et 1 carte de la France. Elles sont mises à jour quotidiennement.
  • Les prédictions: en bas de l’article, les prédictions du nombre de cas final. Elles sont mises à jour quotidiennement. Je rappelle que ces prédictions (i.e. les modèles mathématiques) se basent sur les conditions des dernières semaines (e.g. nombre de contacts moyens par personne et par jour). Ainsi, quand les règles de circulation seront assouplies, rien n’empêchera une seconde vague d’arriver, même si les prédictions ne le montrent pas.
  • L’analyse du cas français: les données spécifiques à la France sur le nombre de personnes en réanimation, nombre de personnes hospitalisés et le nombre de décès à l’échelle nationale et régionale.
  • L’ensemble des graphs mondiaux: même graphs que ceux publiés tri-hebdomadairement mais pour tous les pays du monde ayant plus de 1% des cas mondiaux

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Analyse du 11 Mai 2020

Bonjour à tous,

Pour les graphs:

  • France : Pour ce déconfinement, nous avons autant de cas journaliers qu’au début du confinement. Cependant le nombre de décès journaliers reste plus important qu’au 16/03. Pour les données plus précises sur le nombre d’hospitalisations, le nombre en réanimation et une carte synthétisant tout ça, je vous renvoie vers cette page (située dans Extras -> Le cas français).
  • US : L’évolution du nombre de cas et de morts américains reste assez erratique, mais cela est dû en grande partie au fait que tous les États n’appliquent pas les mêmes règles et que l’épidémie semble s’inscrire dans la durée. Dans l’idéal, il faudrait suivre la situation dans dans chacun des États et non à l’échelle nationale. Une partie de la Maison Blanche a par ailleurs été contrainte de se mettre en quarantaine suite à une circulation active du virus en son sein.
  • Italie : Cela fait une semaine que les italiens sont déconfinés, s’il devait y avoir une recirculation active du virus elle devrait déjà se voir dans les chiffres.
  • Allemagne : De nouveaux clusters étant apparus dans 2 cantons différents (en Rhénanie du Nord-Westphalie, et en Schleswig-Holstein) seulement quelques jours après l’assouplissement des règles de confinement conduisent à la remise en question au niveaux local de ces allègements.

Les modélisations sur le nombre de cas se stabilisent grandement pour les pays européens. Elles prédisent :

  • France : 141 000 cas (nous en avons actuellement 138 854), nous aurions donc atteint 98% des cas et ne devrions voir quasiment aucune évolution après le 22/05. C’est également autour de cette date que nous verrons l’impact du déconfinement sur l’apparition de nouveaux cas.
  • Italie : L’Italie devrait comptabiliser 237 000 cas, et elle en est aujourd’hui à 92% de son chiffre final.
  • Allemagne : On s’attend à 178 000 cas et elle en est à 96% aujourd’hui.
  • US : Je ne note pas les prédictions pour les US, leur situation ne correspondant pas au modèle.

Pour avoir ces modélisations mises à jour quotidiennement, rendez-vous en bas de la page Extras -> Prediction of the epidemic final size

Bonne journée,

Clément

Analyse du 08 Mai 2020

Bonjour à tous,

Comme mercredi nous étudierons la situation au niveau mondial avant de s’intéresser à la France.

Situation mondiale

  • France: entre le 05/05 et le 06/05, nous avons eu +4183 cas. Etant donné que les données sont lissées sur 3 jours (exactement pour les cas comme ça), nous ne le voyons pas comme tel sur le graphs mais comme une augmentation plus faible répartie sur 3 jours. Peut-être cela est-il dû à des retards de remontée des données, d’autant plus que la semaine dernière les chiffres étaient particulièrement bas.
  • US: aucun des indicateurs ne semblent montrer que la situation américaine s’améliore nettement. L’un des arguments principaux pour la réouverture du pays est la précarité qui s’installe dans les familles moins aisées. En effet, le taux de chômage entre Février et Avril a quintuplé (de 3.5% à 14.7%), avec 20,5 millions d’emplois perdus au mois d’Avril. L’équilibre semble donc compliqué à trouver entre précarité sociale et sanitaire.
  • Italie: l’Italie reste dans une situation stable avec +1000 cas/jour et 200/300 morts/jour.
  • Allemagne: similaire à l’Italie.
  • Monde: au niveau mondial, il y a 3.8 millions de cas détectés (0.05% de la population mondiale). L’épidémie a fait 264 000 morts.

Situation française

Une nouvelle page a été créée afin de publier le graph et la carte, mis à jour quotidiennement. D’autre supports pour un suivi régional arriveront bientôt.

La carte a grandement été modifiée, grâce à vos suggestions. Maintenant, vous pouvez, en survolant les régions, avoir le nombre de décès cumulés, le nombre de personnes actuellement en réanimation et hospitalisées. Il aurait été intéressant d’avoir le nombre de cas par région mais il n’est pas communiqué par le gouvernement (ni même le nombre de cas à l’échelle départementale).

Rien à rajouter par rapport à ce qui avait été dit mercredi: la situation s’améliore doucement, mais constamment, dans les hôpitaux à l’échelle nationale. Au déconfinement, les hôpitaux resteront nettement plus chargés que le 16/03, continuons donc à faire attention collectivement.

Bonne journée,

Clément


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  • Les cartes: 3 cartes du monde (nombres de cas, nombres de décès et bilan de la progression du nombre du cas) et 1 carte de la France. Elles sont mises à jour quotidiennement.
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Analyse du 06 Mai 2020

Bonjour à tous,

Aujourd’hui, en plus d’analyser les graphs au niveau mondial, nous nous attarderons plus longuement sur le cas français.

Graphs

  • France: il semble que la baisse du nombre de cas journaliers en France soit inscrit dans la durée. Nous développerons plus sur la France dans la partie suivante.
  • US: même si le nombre de cas journaliers varie très fortement, comme on l’avait envisagé lundi, ce nombre baisse globalement (mathématiquement, les minimums locaux sont de plus en plus bas). Cette baisse reste très lente alors que le président Trump a décidé de dissoudre l’équivalent du conseil scientifique pour le remplacer par un groupe de travail sur la réouverture du pays. Il y a fort à parier qu’une deuxième vague aura lieu dans les semaines à venir, alors que le pays réouvre.
  • Italie: s’il y a des effets de la réouverture progressive de l’Italie, on devrait commencer à les voir à partir de la semaine prochaine, étant donnée la période d’incubation. En attendant, les nombres de morts et de cas continuent de baisser.
  • Allemagne: pour le 4e jour de suite l’Allemagne a moins de 100 morts par jour. Avec 680 nouveaux cas par jour, la situation est semblable à celle de mi-mars.

Situation en France

Pour la France, j’ai repris les données de Santé Publique France afin de pouvoir analyser la situation plus en détail.

Le nombre de personnes en réanimation et hospitalisées est un facteur essentiel pour la sortie de confinement. En effet, la semaine prochaine, étant donné que le pays rouvrira, les nouveaux cas arriveront nécessairement.

Mais, ce qui permettrait d’éviter une vague de décès trop importante, serait la capacité de nos hôpitaux à absorber les malades. C’est le fameux aplatissement de la courbe du nombre de cas journaliers dont on parlait début Mars: plus que chercher à limiter le nombre de cas, on cherche à limiter la vitesse à laquelle ils arrivent (mathématiquement on cherche à diminuer la valeur de la dérivée, pas l’intégrale sous celle-ci).

Ainsi, au vu des chiffres, il semble clair que le 11 mai nous aurons encore au moins 3000 personnes en réanimations et 20/21k personnes hospitalisées. Cependant, on peut s’attendre à ce que les hôpitaux soient mieux préparés.

Ci dessous, la dernière carte des régions, vous pouvez cliquer dessus pour survoler les régions et obtenir plus d’informations. Pour rappel, cette classification est basée sur 2 facteurs (description issue du site data.gouv):

  • la circulation active du virus, basée sur la proportion de passages aux urgences pour une suspicion de COVID-19 ;
  • la tension hospitalière sur les capacités en réanimation, basée sur les taux d’occupation des lits de réanimation par des patients atteints de COVID-19, par rapport à la capacité initiale avant l’épidémie.
Cliquez sur la carte pour la voir en plus grand

Prédictions

Enfin, les prédictions du nombre de cas pour la France, l’Italie et l’Allemagne se précise. Celle des US ne se stabilise pas étant donné le plateau du nombre de cas. Pour accéder à l’ensemble des prédictions, cliquez sur la photo, elles sont tout en bas de l’article.

Bonne journée,

Clément


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Analyse du 04 Mai 2020

Bonjour à tous,

Avant l’analyse du jour, le site a été mis à jour ce WE. Nous avons maintenant 3 outils pour analyser les données:


Ces briefs sont publiés 3 fois par semaine, les lundis, mercredis et vendredis.

La liste complète des outils développés pour l’analyse, disponible sur ce site:

  • Les graphs: publiés tri-hebdomadairement
  • Les cartes: 3 cartes du monde (nombres de cas, nombres de décès et bilan de la progression du nombre du cas) et 1 carte de la France. Elles sont mises à jour quotidiennement.
  • Les prédictions: en bas de l’article, les prédictions du nombre de cas final. Elles sont mises à jour quotidiennement. Je rappelle que ces prédictions (i.e. les modèles mathématiques) se basent sur les conditions des dernières semaines (e.g. nombre de contacts moyens par personne et par jour). Ainsi, quand les règles de circulation seront assouplies, rien n’empêchera une seconde vague d’arriver, même si les prédictions ne le montrent pas.
  • L’analyse du cas français: les données spécifiques à la France sur le nombre de personnes en réanimation, nombre de personnes hospitalisés et le nombre de décès à l’échelle nationale et régionale.
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Maintenant, analysons ces graphs:

  • France: Après 2 semaines pendant lesquelles le nombre de cas a stagné, nous sommes descendus à des niveaux historiquement bas de nouveaux cas journaliers; nous sommes en dessous de la valeur lors de l’entrée en confinement. Au niveau national, on peut dire que la situation s’améliore nettement (je vous oriente vers les cartes du gouvernement pour un état des lieux à une échelle régionale). Cependant, le nombre de personnes en réanimation reste important, même s’il baisse depuis la première semaine d’Avril (3000 contre 600 le 16/03 avec un pic à 7000).
  • US: La situation est très étonnante. Il n’y a quasiment aucun signe d’amélioration. On pourrait imaginer que si les données étaient moyennées sur 7j (durée pour passer d’un maximum local à l’autre) sur la courbe du nombre de cas journaliers, on verrait apparaître globalement une baisse très lente. De même pour le nombre de morts. Mais, même si les US testent plus que nous, la situation n’est quand même pas très encourageante.
  • Italie: l’Italie a entamé l’assouplissement de son confinement depuis hier. On voit d’ailleurs sur les courbes que le nombre de cas journaliers est au plus bas depuis le début du confinement. Le nombre de décès stagne.
  • Allemagne: L’Allemagne, qui a aussi déjà ouvert ses écoles, est en bonne voie. Le nombre de morts journaliers commence à baisser.

Voilà un article intéressant du Monde sur la lecture des chiffres.

Comme indiqué, la comparaison entre pays est compliquée dû à des politiques de tests différentes. Cependant, comme nous l’avons vu dans le brief précédent, on peut essayer de compenser cela.

Bonne journée,

Clément

Analyse du 28 Avril 2020

Bonjour à tous,

Le brief sera en 2 parties aujourd’hui: l’analyse des graphs et une remarque sur les tests.

Analyse du jour

  • France: Alors que le nombre de nouveaux cas journaliers marque un plateau, le nombre de morts journaliers montre une réelle baisse. Il faut espérer que d’ici le 11/05, le nombre de nouveaux cas journaliers soit très inférieur à 1000, sinon nous nous retrouverions dans une situation semblable à celle de l’entrée en confinement, même si les déplacements resteront limités.
  • US: Le nombre de cas a dépassé 1 million. Dans le paragraphe sur les tests, nous verrons que ce chiffre important n’est pas forcément expliqué par le nombre de tests.
  • Italie: Avec 2000 cas en plus par jour, l’Italie est dans une situation semblable à la France ou l’Allemagne. Elle a, de plus, autant de cas supplémentaires par jour que mi-mars, au moment du confinement.
  • Allemagne: Si l’Allemagne continue sur cette voie elle devrait avoir 1000 cas en plus/j d’ici la fin de la semaine, la ramenant à sa situation début mars, ce serait le premier pays durement touché européen à passer cette barre.

Quelques réflexions sur le nombre de test

On peut s’intéresser à deux chiffres:

  • Pourcentage de la population testée: l’Italie est le pays qui effectue le plus de tests, elle avait, au 25 avril, testé 2.97% de sa population (1.8 millions de tests effectués). Les US, eux, ont testé 1.56% de leur population avec 5.59 millions de tests. Enfin, la France est clairement derrière avec environ 595 144 tests, on a donc testé moins de 1% de notre population.
  • Positivité des tests: il est intéressant de comparer le taux de positivité des tests effectués. Cela permet de se rendre compte si le nombre de tests est suffisant. Ainsi aux US 17,2% des tests sont positifs, en Italie 10,7%, en France 22%. Plus le nombre de tests est important, plus la population testée est variée.

Ces chiffres nous indiquent que le nombre de cas aux US n’est sûrement pas sur-estimé par rapport au nombre de cas italiens. On peut vraisemblablement considérer que les US ont au moins 5x plus de cas que l’Italie.

Quant à la France, imaginons que, comme l’Italie nous testions 3% de notre population et que, étant donnée notre situation assez semblable, nous ayons également 11% de tests positifs. Cela porterait notre nombre de cas à 221 000 cas contre 129 000 aujourd’hui.

Ce nombre de cas nous amènerait à 0.3% de cas dans la population, chiffre semblable à celui italien.

Finalement, on peut donc comparer le cas américain, italien et français comme suit: l’Italie et la France ont semblablement le même nombre de cas, supérieur à 200 000. Les US ont un nombre de cas qui a dépassé le million. Ce qui porte le nombre de cas par habitant américain, français et italien à la même proportion (environ 0.3%). Cependant, alors que l’Italie et la France ont clairement entamé une phase de décroissance, ce n’est pas le cas pour les US.

Pour en savoir plus sur le nombre de test, cet article est très complet. Les chiffres viennent également de cet article.

Bonne journée,

Clément

Analyse du 26 Avril 2020

Bonjour à tous,

Tout d’abord, sur les chiffres du jour:

  • France: L’évolution du nombre de cas journaliers sur la semaine dernière a marqué un plateau. Sur les 9 derniers jours, globalement, on a toujours 2000 cas supplémentaires par jour. Ce plateau confirme la nécessité de continuer à appliquer de manière stricte les règles de confinements. Du côté des décès nous observons des signes d’améliorations mais 38% restent des résidents en EHPAD. De plus, un dernier bilan provisoire fait état d’une mortalité de 30% à 40% en réanimation.
  • US: Alors que le nombre de cas tutoie le million (938 154), les mesures de confinement sont de mois en moins respectées. La baisse n’est d’ailleurs toujours pas engagée.
https://www.nytimes.com/2020/04/26/us/coronavirus-updates.html?action=click&module=Spotlight&pgtype=Homepage
  • Italie: L’Italie observe le même plateau que la France mais à +3000 cas/jours.
  • Allemagne: Pour l’Allemagne, la baisse du nombre de cas stagne également à 1000 cas/j mais seulement depuis 3 jours. Le nombre de morts journaliers est constant à 200/j depuis environ le début du mois.

Ensuite, quelques mots sur les modélisations de vendredi dernier:

Je vais écrire un article plus en profondeur cette semaine, détaillant ces modélisations, mais le comportement des derniers jours avec cette stagnation du nombre de cas rend le modèle peu exact (cf courbe de droite). Le modèle prédit donc de plus en plus de cas à t=\infty &s=1. Depuis vendredi on est passé de 125 000 à 126 000 cas finaux et une sortie de crise qui s’est décalée de 1 jour, elle est maintenant estimée au 05/05/2020.

Comme je l’ai indiqué vendredi dernier, ce modèle reste assez simple et n’est pas à prendre au pied de la lettre.

Bonne journée,

Clément